2002年9月10号，911事件一周年的前夕，他接受BBC的访问：

“整起911事件，与艺术作品在某方面有一些相似性...。当然，这起事件在视觉效果上很惊人，你不得不承认，他们(指引发事件的攻击者)做了一件谁都想不到的大事，尤其是对美国这样的大国。在某些方面他们的成就值得喝采，因为他们让大部分的人都相形失色，尽管是一件非常危险的事。”

新闻稿刊出的一周内，赫斯特的发言引来各界的挞伐。他随后透过公司发表了声明稿：

“对于我所引发的任何不快，尤其是对这起可怕的事件的受害者家属，我表达诚挚的歉意。”

2003年四月，沙奇艺廊在伦敦郡议会举办展览，包括赫斯特的回顾展。这次的展览使两人之间的紧张关系进一步恶化，赫斯特甚至不把这次的展览纪录在他的个人履历之中。起因是赫斯特一件为了慈善事业而创作的作品-一辆被涂上他的商标图样的迷你-被煞有介事地展出，但赫斯特认为那只是即兴之作。这起事件也导致之后将在泰特现代艺术馆举办的回顾展被取消。他指责沙奇“幼稚”，“我可不是查里斯·沙奇的猴子.。.他只凭金钱的价值来评断艺术.。.他以为他可以靠金钱的力量来影响艺术，而且他一直执迷不悟。”

2003年九月，“不确定年代中的罗曼史”在伦敦白方块艺廊展出，展览和作品的收入据报道高达一千一百万英镑，使他的财产增加到三千五百万英镑以上，塑像作品“慈善(Charity)”被一位韩国百货公司的业主以一百五十万英镑买走，展示在他所开设的百货公司之中。这件作品高6.7米，重达六吨，是一位患有小儿麻痹、右腿装着铁制辅助支架的小女孩，并抱着一只猫和一个捐献箱。捐献箱是坏的，里头空无一物。

“慈善”的副本在伦敦哈克斯顿广场展出，摆设在白方块艺廊前。艺廊内的地下室有12个玻璃柜，分别代表耶稣的十二门徒。每个箱子里都装着血腥、恐怖的摆设，象征各个门徒的命运与遭遇。最后还有个空的柜子，代表耶稣本人。在艺廊楼上，有四个小玻璃箱，装着插满剪刀利刃的牛头。这样的作品被认为是传统天主教意象中“超凡的灵性体验”。同时，赫斯特从沙奇手中买回自己的12件作品，是沙奇所藏赫斯特作品数量的三分之一。总共的金额据报道高达八百万英镑。后沙奇时期，2004–2004年五月24日，艺术品仓储与转运公司莫马特的仓库发生大火，火灾摧毁了沙奇的大量收藏品，包括17件赫斯特的作品。慈善这件塑像放在仓库外的广场上，因此逃过一劫。

七月，赫斯特发表有关他与沙奇之间关系的谈话：“我尊敬查理斯。我们之间其实没有什么嫌隙，如果我们碰面，我们会聊天，但总之我们也不是互相称兄道弟的好伙伴就是了。”

年底，赫斯特受托为Band Aid设计单曲封面，样式是一个非洲孩子蹲坐在地上，但这样的设计不受欣赏，唱片公司用一只站在雪中的驯鹿和小孩代替。

12月，生者对者无动于衷被沙奇售出，买主是美国艺术品收藏家、格林威治对冲基金经理Steve Cohen，金额达到1200万美金(650万英镑)，由赫斯特在纽约的仲介Gagosian促成。Cohen随后将这件作品捐赠给纽约现代艺术博物馆。尼可拉斯·赛洛塔曾希望买下它并展示在泰特美术馆，英国影子内阁的艺术部门阁员雨果·斯威尔(Hugo Swire)甚至曾发公文请政府尽力让该作品留在国内，然而当前英国的艺术品出口法规无法限制仍在世的艺术家。

2005年3月，纽约Gagosian Gallery展出赫斯特的30件绘画作品。这些作品历时3年半完成，以照片为基础并由助手协助，作后由赫斯特亲自完成。

2006年2月，墨西哥Hilario Galguera Gallery举办赫斯特的展览“神之死，在没有神的愚者之船上更了解生命(The Death of God, Towards a Better Understanding of Life without God aboard The Ship of Fools)”。这是赫斯特第一次在拉丁美洲举办展览，吸引了当地媒体大幅报道。

2006年，赫斯特的一千年与四份三连画，包含一件新的甲醛制品：寂寞之寂静(The Tranquility of Solitude)于Gagosian Gallery和法兰西斯·培根的一幅三连画并肩展出。“寂寞之寂静”这件作品乃是受到培根的启发而作。

赫斯特可以说是英国最贵的当代艺术家。赫斯特曾用价值约800万-1000万英镑的8500颗钻石装饰一个骷髅头，经分析确认，所用的头颅属于一名大约35岁的欧洲人，生活在18或19世纪初。这件作品中最名贵的当属一枚摆在前额、重约50克拉的钻石。这件白金钻石骷髅头作品名为《给上帝的爱》，赫斯特曾表示：“我只想借诅咒死亡来赞美生命，有什么方法比采用奢华、欲望和堕落的象征更能遮盖死亡？”2007年8月30日，这颗钻石骷髅头创造出1亿美元成交价，并创下在世艺术家作品售价最高纪录。

风格

赫斯特对科学和艺术之间的联系一直很感兴趣。他常常往自己的作品中注入医学的元素，比如药品，药橱和药片等；他的“点”画模拟的是医学颜色代码。赫斯特也常常使用日常生活中的素材，比如办公桌椅和香烟，这在作品“对逃亡的后天无能”[The Acquired Inability to Escape]里可以看得出来。尽管作品里并没有人类作为主角，但却暗含着人的缺席。我们面对的是一个人造环境，简洁干净的现代玻璃窗的设计同样提醒着我们：这是一个水族馆或者是动物园。尽管，赫斯特通过玻璃窗里的香烟想要展示的是逃离的概念，但因为玻璃窗是密封的，所以从这个白领存在的空间里逃出去是不可能的。一把转椅和一张桌子，这种典型的办公用品元素，被用来当作人类存在过的标志，就象人类学的手工艺品。赫斯特通过这件作品，也在暗示生活不能在一个贫瘠和人造的环境里，被简化的只具有功能性。

赫斯特对于生物生命的有限性也十分感兴趣。他最著名的“自然历史”系列作品由动物尸体组成，部分作品还经过切割，保存在甲醛容器中。该系列的标志性作品《生者对死者无动于衷》，是一条用甲醛保存在玻璃柜中的5米长虎鲨。“迷途的羔羊”[Away From the Flock，1994]也是其中之一，是一只泡在这种液体里的羔羊。在作品“女孩，喜欢男孩，喜欢男孩，喜欢女孩，就像女孩，喜欢男孩”[Girls, Who Like Boys, Who Like Boys, Who Like Girls, Like Girls, Like Boys，2006]里，画的表层装饰满了非常漂亮的彩蝶，不过也有让人忧虑的剃须刀。赫斯特在此提醒观众的是生命的短暂。虽说蝴蝶让画的表层变得非常漂亮，但是剃须刀让人联想到的是“镜中花月”的画面，它提醒我们危险的存在和物质的美的非永久性。作品的名称取自1995年英国著名流行乐队，模糊乐队的一首歌“男孩和女孩”，画布上的色彩突出的是生理吸引的复杂性。

赫斯特是国际公认的英国最具影响力的艺术家。近来，他开始致力于在伦敦和格洛斯特郡拓展新的展览空间，以此来推动当代艺术的发展。同时，他打算在格洛斯特郡建立一个博物馆。